{"id":1356,"date":"2018-03-13T21:21:27","date_gmt":"2018-03-13T21:21:27","guid":{"rendered":"http:\/\/qfm.uc.pt\/?page_id=1356"},"modified":"2018-03-13T21:21:27","modified_gmt":"2018-03-13T21:21:27","slug":"analise-conformacional-de-poliaminas-estudo-por-espectroscopia-vibracional-e-calculos-ab-initio","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/qfm.uc.pt\/index.html\/language\/en\/projects\/analise-conformacional-de-poliaminas-estudo-por-espectroscopia-vibracional-e-calculos-ab-initio\/","title":{"rendered":"An\u00e1lise Conformacional de Poliaminas: Estudo por Espectroscopia Vibracional e C\u00e1lculos Ab Initio"},"content":{"rendered":"<p><strong>Poliaminas ac\u00edclicas\u00a0<\/strong><br \/>\nConsiderou-se uma s\u00e9rie alargada de\u00a0\u00f0a\u00f0,\u00f0w-diaminas de forma a conhecer as suas prefer\u00eancias conformacionais e o modo como se correlacionam com as das poliaminas biog\u00e9nicas espermina (sp) e espermidina (spd).<br \/>\nA import\u00e2ncia do estabelecimento de liga\u00e7\u00f5es de hidrog\u00e9nio intramoleculares (N-H<sup>\u2026<\/sup>N e\/ou C-H<sup>\u2026<\/sup>N) foi testada atrav\u00e9s de c\u00e1lculos\u00a0<i>ab initio<\/i>. O estudo dos efeitos de solvente pelo m\u00e9todo SCRF permitiu avaliar a import\u00e2ncia relativa das interac\u00e7\u00f5es intra- e intermoleculares.<br \/>\nForam obtidos e analisados os espectros vibracionais de FTIR, Raman e Difus\u00e3o Inel\u00e1stica de Neutr\u00f5es (INS). Esta \u00faltima t\u00e9cnica \u00e9 particularmente adequada ao estudo de materiais hidrogenados e de modos de vibra\u00e7\u00e3o de baixa frequ\u00eancia. Foram simulados te\u00f3ricamente os espectros de INS e comprovada a adequa\u00e7\u00e3o das funcionais de densidade para esta previs\u00e3o e consequente an\u00e1lise de resultados experimentais.<\/p>\n<p><strong>Poliaminas c\u00edclicas\u00a0<\/strong><br \/>\nProcedeu-se \u00e0 an\u00e1lise conformacional do 1,4-diazaciclohexano, em fun\u00e7\u00e3o do pH. Assim, foram calculados as geometrias e modos vibracionais de 16 conforma\u00e7\u00f5es nos seus v\u00e1rios estados de protona\u00e7\u00e3o e os efeitos de solvente nos equil\u00edbrios conformacionais foram avaliados. Foram obtidos espectros Raman e, a partir deles, determinadas as constantes de protona\u00e7\u00e3o em solu\u00e7\u00e3o aquosa (pK\u00b4s).<br \/>\nEfectuaram-se c\u00e1lculos\u00a0<i>ab initio<\/i>, com optimiza\u00e7\u00e3o total de geometria, para 11 m\u00ednimos de energia de 1,4,7-triazaciclononano e 20 m\u00ednimos de energia de 1,4,7,10-tetrazaciclododecano e seus diferentes estados de protona\u00e7\u00e3o, tendo-se determinado o conjunto de pseudopotenciais mais adequado para utiliza\u00e7\u00e3o em poliazamacrociclos. Os espectros de Raman e FTIR destas mol\u00e9culas foram obtidos e analisados.<br \/>\nRealizaram-se tamb\u00e9m c\u00e1lculos ab initio em sistemas c\u00edclicos nos quais os \u00e1tomos de N foram total ou parcialmente substitu\u00eddos por O e\/ou S. Verificou-se que as estruturas de menor energia s\u00e3o an\u00e9is distorcidos, estabilizados por duas interac\u00e7\u00f5es intramoleculares 1,5: CH<sup>&#8230;<\/sup>O ou CH<sup>&#8230;<\/sup>S. A ocorr\u00eancia deste tipo de interac\u00e7\u00f5es, j\u00e1 comprovada experimentalmente, foi pela primeira vez prevista por m\u00e9todos te\u00f3ricos.<br \/>\nO mesmo m\u00e9todo de c\u00e1lculo foi usado para determinar as prefer\u00eancias de complexa\u00e7\u00e3o de diferentes ligandos macroc\u00edclicos em rela\u00e7\u00e3o aos metais alcalinos, alcalino-terrosos e alguns metais de transi\u00e7\u00e3o. Avaliou-se a influ\u00eancia de: i) aumento das dimens\u00f5es da cavidade interna do ligando; ii) aumento do n\u00ba de hetero\u00e1tomos; e iii) altera\u00e7\u00e3o do hetero\u00e1tomo.<br \/>\nNos casos em que a cavidade do ligando se mostra demasiado pequena para incluir o i\u00e3o met\u00e1lico, verificou-se a forma\u00e7\u00e3o de complexos do tipo ML<sub>2<\/sub>\u00a0que apresentam geometrias octa\u00e9dricas (e.g. Fe<sup>2+<\/sup>, Fe<sup>3+<\/sup>) ou planares quadradas (e.g. Pd<sup>2+<\/sup>, Pt<sup>2+<\/sup>).<\/p>\n<p>Efeito citot\u00f3xico e anti-tumoral de complexos de Pt(II) com poliaminas biog\u00e9nicas<br \/>\nProcedeu-se ao estudo das propriedades citot\u00f3xicas e anti-proliferativas de diferentes complexos polinucleares de Pt(II) [(spdH<sub>3<\/sub>)<sub>2<\/sub>(PtCl<sub>4<\/sub>)<sub>3<\/sub>, [PtCl<sub>2<\/sub>(spdH)]<sub>2<\/sub>(PtCl<sub>4<\/sub>), (PtCl<sub>2<\/sub>)<sub>3<\/sub>(spd)<sub>2<\/sub>\u00a0e (PtCl<sub>2<\/sub>)<sub>2<\/sub>(sp)] em linhas celulares cancer\u00edgenas humanas. Os quelatos foram preparados de modo a variar o n\u00famero e tipo de coordena\u00e7\u00e3o dos centros met\u00e1licos, com vista a estabelecer a rela\u00e7\u00e3o estrutura-actividade que determina a efic\u00e1cia deste tipo de compostos. Os valores de densidade e de viabilidade celulares, ap\u00f3s per\u00edodos vari\u00e1veis de exposi\u00e7\u00e3o \u00e0 droga, foram determinados.<br \/>\nForam obtidos e analisados os espectros FT-Raman destes complexos.<\/p>\n<p><b>State<\/b><br \/>\nFinished<br \/>\n<b>Period<\/b><br \/>\n1996 to 1999<br \/>\n<b>Funding<\/b><br \/>\n6.435.000 Portuguese escudos<br \/>\n<b>Project code<\/b><br \/>\nPBIC\/C\/QUI\/2219\/95<br \/>\n<b>Financial Entity<\/b><br \/>\nJunta Nacional de Investiga\u00e7\u00e3o Cient\u00edfica e Tecnol\u00f3gica (JNICT) \u2013 Portugal<\/p>\n<p><b>Membros<\/b><br \/>\n<a href=\"http:\/\/qfm.uc.pt\/luis-batista-de-carvalho-2\/\">Lu\u00eds Alberto Batista de Carvalho<\/a>\u00a0(Principal Investigator)<br \/>\n<a href=\"http:\/\/qfm.uc.pt\/antonio-amorim-da-costa-2\/\">Ant\u00f3nio Marinho Amorim da Costa<\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/qfm.uc.pt\/maria-paula-marques-2\/\">Maria Paula Matos Marques Catarro<\/a><br \/>\nPaulo Jorge de Almeida Ribeiro Claro<\/p>\n<p><b>Publications<\/b><br \/>\n<a href=\"https:\/\/drive.google.com\/file\/d\/0B_btGj75B4fxN2l1ck9CVTM4ZUE\/view?usp=sharing\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Study of Biogenic and\u00a0\u00f0a,\u00f0w-Polyamines by Combined Inelastic Neutron Scattering and Raman Spectroscopies, and Ab Initio MO Calculations\u00a0<\/a><br \/>\nM.P.M. Marques, L.A.E. Batista de Carvalho and J. Tomkinson<br \/>\nThe Journal of Physical Chemistry A\u00a0<b>106<\/b>, 2473-2482 (2002)<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/drive.google.com\/file\/d\/0B_btGj75B4fxcUZJT1c2NC1PR0U\/view?usp=sharing\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Theoretical Approach to the Conformational Preferences of Putrescine\u00a0<\/a><br \/>\nM.P.M. Marques and L.A.E. Batista de Carvalho<br \/>\nD.M.L. Morgan, A. White, F. S\u00e1nchez-Jim\u00e9nez and S. Bardocz (Eds.).\u00a0<i>COST 917: Biogenically Active Amines in Food<\/i>. European Commission, Luxembourg, vol. IV, 122-129 (2000)<\/p>\n<p>Conformational Studies on Biogenic Polyamines<br \/>\nM.P.M. Marques, L.A.E. Batista de Carvalho and J. Tomkinson<br \/>\nThe Rutherford Appleton Laboratory, ISIS Facility Annual Report (1999-2000)<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/drive.google.com\/file\/d\/0B_btGj75B4fxNVpHV0RNRUtTWHM\/view?usp=sharing\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Conformational Study of 1,2-Diaminoethane by Combined Ab Initio MO\u00a0<\/a><br \/>\n<a href=\"https:\/\/drive.google.com\/file\/d\/0B_btGj75B4fxNVpHV0RNRUtTWHM\/view?usp=sharing\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Calculations and Raman Spectroscopy<\/a><br \/>\nL.A.E. Batista de Carvalho, L.E. Louren\u00e7o and M.P.M. Marques<br \/>\nJournal of Molecular Structure\u00a0<b>482<\/b>, 639-646 (1999)<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Poliaminas ac\u00edclicas\u00a0 Considerou-se uma s\u00e9rie alargada de\u00a0\u00f0a\u00f0,\u00f0w-diaminas de forma a conhecer as suas prefer\u00eancias conformacionais e o modo como se correlacionam com as das poliaminas biog\u00e9nicas espermina (sp) e espermidina (spd). A import\u00e2ncia do estabelecimento de liga\u00e7\u00f5es de hidrog\u00e9nio intramoleculares (N-H\u2026N e\/ou C-H\u2026N) foi testada atrav\u00e9s de c\u00e1lculos\u00a0ab initio. 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